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苹果树腐烂病是有一种弱寄生性的真菌引起的，病菌入侵后在死亡的皮层组织中潜伏，当树皮组织垂死或已死亡时，病菌开始活动，引起树皮腐烂。从夏季在新形成的落皮层上出现表面溃疡开始，至翌年春季苹果树进入生成期，冬春发病盛期结束，是腐烂病的发病周期。苹果树腐烂病菌寄生性很弱，能在树皮各部潜伏。树势衰弱，愈伤能力低，常引起腐烂病流行。栽培管理粗放，土壤板结，根系发育不良，结果过多，肥水供应不足，其他病虫防治不好引起早期落叶、冬春冻伤害等都是病害流行的原因。
夏季是苹果树活跃生长期，不利于病菌扩展致病。但落皮层及其它部位的垂死组织为腐烂病的传播、侵染创造了良好条件，侵入树皮的病菌在此扩展后形成很小的表皮溃疡斑。6～7月是果树落皮层形成期，是苹果树腐烂病防治的关键时期。一般来说，新梢停长以后，果树枝干转向加粗生长，落皮层形成。
防治对策：6月中下旬新落皮层形成而尚未出现表面溃疡时对主干、主枝涂刷药剂。在新梢停长后1～2周内，用杀菌剂加渗透剂进行第一次涂干，间隔半个月，进行第二次涂干。推荐甲硫萘乙酸涂干，杀死已经侵染或扩展的病菌，减少表面溃疡的形成。